一种信号通路水平结直肠癌细胞系选择新视角探讨

doi:10.3877/cma.j.issn.2095-3224.2025.02.011

中华结直肠疾病电子杂志 ›› 2025, Vol. 14 ›› Issue (02) : 179 -183. doi: 10.3877/cma.j.issn.2095-3224.2025.02.011

经验交流

一种信号通路水平结直肠癌细胞系选择新视角探讨

王飞¹, 张凯², 姚占胜¹^,^†(

)

^1. 044000 运城，山西省运城市中心医院结直肠肛门外科
^2. 130022 长春，吉林大学第二医院结直肠肛门外科

收稿日期:2024-11-12 出版日期:2025-04-25
通信作者: 姚占胜

A new perspective on signaling pathway level selection of colorectal cancer cell lines

Fei Wang¹, Kai Zhang², Zhansheng Yao¹^,^†()

^1. Department of Colorectal and Anal Surgery，Yuncheng Central Hospital of Shanxi Province，Yuncheng 044000，China
^2. Department of Colorectal and Anal Surgery，the Second Hospital of Jilin University，Changchun 130022，China

Received:2024-11-12 Published:2025-04-25
Corresponding author: Zhansheng Yao

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目的

为选择与研究目的相适配的结直肠癌细胞系提供选择的新策略。

方法

将Berg等人研究的转录组结果通过基因集变异分析刻画不同结直肠癌细胞系通路特征。

结果

不同细胞系展现多样化癌症通路特征；不同分型之间结直肠癌细胞系仍可能有类似通路偏好。

结论

结直肠癌细胞系选择存在极大的研究价值，我们提供了一个以肿瘤细胞系生物学行为为主的新视角。

关键词: 转录组学, 结直肠癌细胞系, 信号通路富集分析

Objective

To provide a new strategy for selecting colorectal cancer cell lines that are compatible with the research objectives.

Methods

The transcriptome results of Berg et al. were analyzed using pathway variation analysis to characterize the pathway features of different colorectal cancer cell lines.

Results

Different cell lines exhibit diverse cancer pathway features. Similar pathway preferences may still exist between different subtypes of colorectal cancer cell lines.

Conclusion

The selection of colorectal cancer cell lines has great research value and we provides with a new perspective on the biological behavior of tumor cell lines.

Key words: Transcriptomics, Colorectal cancer cell line, Signal path enrichment analysis

图1 CMS/CIMP/MSI分型下34种结直肠癌细胞系Hallmark 基因集通路打分

图2 CMS/CIMP/MSI分型下34种结直肠癌细胞系34种KEGG基因集通路打分

图3 CMS/CIMP/MSI分型下34种结直肠癌细胞系18种细胞死亡方式通路打分

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